Klamidija je s 127 primeri v letu 2008 druga najpogostejša SPO v Sloveniji. Povzročajo jo določeni sevi znotrajcelične bakterije Chlamydia trachomatis. Prvi znaki se ponavadi pojavijo po tednu ali dveh po okužbi. Moški opazijo prozoren do motno bel izcedek iz sečnice, ki ne smrdi, in pogostejše, pekoče mokrenje. Podobni so tudi znaki pri ženskah – boleče, pogostejše mokrenje, sluzast belkast izcedek, bolečine v spodnjem predelu trebuha. Pomembno se je zavedati, da se simptomi pojavijo le pri polovici okuženih moških in manj kot tretjini okuženih žensk. Število prepoznanih okužb je torej bistveno nižje od dejanskega števila okuženih. Poleg tega simptomi ponavadi izginejo tudi brez zdravljenja, kar pa ne pomeni, da smo se okužbe znebili. Nezdravljena klamidijska okužba ima lahko resne posledice pri obeh spolih. Navsezadnje je vodilni vzrok neplodnosti in zunajmaternične nosečnosti.